Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ7

PROCA1, Protein PROCA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROCA1Q8NCQ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PROCA1Q8NCQ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROCA1Q8NCQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PROCA1Q8NCQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PROCA1Q8NCQ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms