Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF38AQ8NAV1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms