Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSL3Q8N5Y2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSL3Q8N5Y2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms