Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RPAP2Q8IXW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPAP2Q8IXW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAP2Q8IXW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms