Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNTD2Q8IXW0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNTD2Q8IXW0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNTD2Q8IXW0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms