Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML1Q86YW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms