Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PPARGC1BQ86YN6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PPARGC1BQ86YN6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
PPARGC1BQ86YN6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPARGC1BQ86YN6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms