Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SKAP1Q86WV1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SKAP1Q86WV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SKAP1Q86WV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms