Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms