Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2R2Q712K3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2R2Q712K3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms