Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP30Q70CQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP30Q70CQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP30Q70CQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms