Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00173Q6ZV60 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms