Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NFXL1Q6ZNB6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFXL1Q6ZNB6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFXL1Q6ZNB6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms