Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP6Q6ZN66 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP6Q6ZN66 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP6Q6ZN66 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms