Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD4L3Q6VB84 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms