Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN7

TOMM20L, TOMM20-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20LQ6UXN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20LQ6UXN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20LQ6UXN7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20LQ6UXN7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOMM20LQ6UXN7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20LQ6UXN7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOMM20LQ6UXN7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms