Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC171Q6TFL3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC171Q6TFL3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC171Q6TFL3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms