Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO38Q6PIJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO38Q6PIJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms