Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD4Q6IC98 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms