Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM200BQ69YZ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms