Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDCA2Q69YH5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA2Q69YH5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms