Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
INTS3Q68E01 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
INTS3Q68E01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
INTS3Q68E01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms