Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD2Q68DH5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD2Q68DH5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms