Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BROXQ5VW32 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms