Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms