Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLEC12Q5KU26 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COLEC12Q5KU26 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLEC12Q5KU26 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms