Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLRC3Q5JS37 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC3Q5JS37 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms