Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAN3Q58A45 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAN3Q58A45 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms