Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
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KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
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KRTAP21-1Q3LI58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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