Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC27Q2M243 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC27Q2M243 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms