Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC6Q16204 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC6Q16204 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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