Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA1CQ13936 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1CQ13936 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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