Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf61Q13536 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf61Q13536 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf61Q13536 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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