Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BFSP2Q13515 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BFSP2Q13515 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BFSP2Q13515 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BFSP2Q13515 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BFSP2Q13515 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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