Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAPC2Q13487 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC2Q13487 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
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