Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTP4A2Q12974 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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