Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
GRIN2AQ12879 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
GRIN2AQ12879 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
GRIN2AQ12879 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
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