Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
HMGXB3Q12766 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC43.07■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
HMGXB3Q12766 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
HMGXB3Q12766 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC42.92■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms