Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A7Q0GE19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A7Q0GE19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A7Q0GE19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms