Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EP300Q09472 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EP300Q09472 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EP300Q09472 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EP300Q09472 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EP300Q09472 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EP300Q09472 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EP300Q09472 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EP300Q09472 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EP300Q09472 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EP300Q09472 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP300Q09472 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP300Q09472 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP300Q09472 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP300Q09472 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP300Q09472 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP300Q09472 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP300Q09472 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP300Q09472 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP300Q09472 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EP300Q09472 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EP300Q09472 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EP300Q09472 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP300Q09472 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP300Q09472 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP300Q09472 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP300Q09472 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP300Q09472 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP300Q09472 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP300Q09472 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP300Q09472 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP300Q09472 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP300Q09472 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP300Q09472 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP300Q09472 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP300Q09472 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP300Q09472 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP300Q09472 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EP300Q09472 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP300Q09472 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP300Q09472 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP300Q09472 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP300Q09472 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP300Q09472 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP300Q09472 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP300Q09472 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP300Q09472 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP300Q09472 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP300Q09472 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP300Q09472 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP300Q09472 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EP300Q09472 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP300Q09472 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP300Q09472 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP300Q09472 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP300Q09472 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP300Q09472 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EP300Q09472 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EP300Q09472 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EP300Q09472 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EP300Q09472 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EP300Q09472 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EP300Q09472 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EP300Q09472 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EP300Q09472 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EP300Q09472 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EP300Q09472 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EP300Q09472 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EP300Q09472 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EP300Q09472 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EP300Q09472 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EP300Q09472 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EP300Q09472 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EP300Q09472 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EP300Q09472 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EP300Q09472 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EP300Q09472 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EP300Q09472 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EP300Q09472 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EP300Q09472 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EP300Q09472 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EP300Q09472 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EP300Q09472 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EP300Q09472 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms