Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDSRQ06136 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDSRQ06136 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDSRQ06136 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms