Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SP3Q02447 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP3Q02447 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP3Q02447 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP3Q02447 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP3Q02447 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP3Q02447 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SP3Q02447 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP3Q02447 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP3Q02447 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP3Q02447 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP3Q02447 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP3Q02447 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP3Q02447 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP3Q02447 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP3Q02447 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP3Q02447 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP3Q02447 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP3Q02447 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP3Q02447 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SP3Q02447 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SP3Q02447 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SP3Q02447 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SP3Q02447 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SP3Q02447 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SP3Q02447 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SP3Q02447 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SP3Q02447 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SP3Q02447 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP3Q02447 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SP3Q02447 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SP3Q02447 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SP3Q02447 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SP3Q02447 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SP3Q02447 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP3Q02447 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP3Q02447 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SP3Q02447 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SP3Q02447 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP3Q02447 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP3Q02447 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP3Q02447 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SP3Q02447 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP3Q02447 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP3Q02447 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP3Q02447 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP3Q02447 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP3Q02447 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP3Q02447 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP3Q02447 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP3Q02447 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP3Q02447 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP3Q02447 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SP3Q02447 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP3Q02447 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP3Q02447 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP3Q02447 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP3Q02447 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP3Q02447 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP3Q02447 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP3Q02447 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP3Q02447 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP3Q02447 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms