Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms