Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H3F3AP84243 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3AP84243 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3AP84243 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3AP84243 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3AP84243 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3AP84243 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3AP84243 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3AP84243 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3AP84243 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3AP84243 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3AP84243 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3AP84243 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3AP84243 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3AP84243 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3AP84243 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3AP84243 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3AP84243 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3AP84243 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3AP84243 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3AP84243 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3AP84243 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3AP84243 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3AP84243 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3AP84243 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3AP84243 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3AP84243 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3AP84243 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3AP84243 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3AP84243 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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