Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TMF1P82094 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TMF1P82094 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMF1P82094 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TMF1P82094 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TMF1P82094 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMF1P82094 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMF1P82094 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMF1P82094 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMF1P82094 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMF1P82094 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TMF1P82094 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMF1P82094 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMF1P82094 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMF1P82094 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMF1P82094 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMF1P82094 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMF1P82094 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMF1P82094 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMF1P82094 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMF1P82094 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TMF1P82094 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMF1P82094 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMF1P82094 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TMF1P82094 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMF1P82094 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMF1P82094 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMF1P82094 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMF1P82094 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMF1P82094 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMF1P82094 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMF1P82094 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMF1P82094 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMF1P82094 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMF1P82094 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMF1P82094 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMF1P82094 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMF1P82094 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMF1P82094 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMF1P82094 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMF1P82094 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMF1P82094 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMF1P82094 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMF1P82094 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMF1P82094 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMF1P82094 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TMF1P82094 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TMF1P82094 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TMF1P82094 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TMF1P82094 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TMF1P82094 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMF1P82094 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TMF1P82094 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMF1P82094 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMF1P82094 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMF1P82094 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMF1P82094 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMF1P82094 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMF1P82094 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMF1P82094 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMF1P82094 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMF1P82094 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMF1P82094 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TMF1P82094 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMF1P82094 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMF1P82094 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMF1P82094 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMF1P82094 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMF1P82094 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TMF1P82094 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TMF1P82094 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TMF1P82094 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TMF1P82094 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMF1P82094 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMF1P82094 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMF1P82094 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMF1P82094 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMF1P82094 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TMF1P82094 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMF1P82094 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMF1P82094 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMF1P82094 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMF1P82094 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMF1P82094 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMF1P82094 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMF1P82094 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMF1P82094 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMF1P82094 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMF1P82094 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMF1P82094 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMF1P82094 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMF1P82094 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMF1P82094 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMF1P82094 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMF1P82094 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMF1P82094 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMF1P82094 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TMF1P82094 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms