Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF3P78545 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF3P78545 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF3P78545 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF3P78545 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF3P78545 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF3P78545 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF3P78545 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF3P78545 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF3P78545 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF3P78545 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF3P78545 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELF3P78545 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ELF3P78545 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELF3P78545 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELF3P78545 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELF3P78545 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF3P78545 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF3P78545 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF3P78545 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF3P78545 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF3P78545 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF3P78545 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF3P78545 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELF3P78545 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELF3P78545 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELF3P78545 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELF3P78545 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELF3P78545 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELF3P78545 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELF3P78545 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELF3P78545 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELF3P78545 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELF3P78545 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELF3P78545 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELF3P78545 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELF3P78545 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELF3P78545 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELF3P78545 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELF3P78545 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELF3P78545 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELF3P78545 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELF3P78545 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELF3P78545 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELF3P78545 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms