Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P62891 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P62891 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P62891 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P62891 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P62891 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P62891 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P62891 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P62891 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P62891 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P62891 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P62891 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P62891 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P62891 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P62891 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P62891 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P62891 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P62891 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P62891 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P62891 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P62891 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P62891 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P62891 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P62891 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P62891 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P62891 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P62891 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P62891 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P62891 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P62891 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P62891 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P62891 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P62891 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P62891 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P62891 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P62891 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P62891 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P62891 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms