Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSNL1P62760 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSNL1P62760 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms