Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PROK1P58294 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PROK1P58294 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PROK1P58294 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PROK1P58294 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PROK1P58294 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PROK1P58294 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PROK1P58294 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PROK1P58294 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PROK1P58294 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PROK1P58294 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PROK1P58294 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PROK1P58294 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PROK1P58294 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PROK1P58294 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PROK1P58294 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PROK1P58294 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PROK1P58294 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PROK1P58294 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PROK1P58294 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PROK1P58294 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PROK1P58294 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PROK1P58294 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PROK1P58294 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PROK1P58294 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PROK1P58294 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PROK1P58294 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PROK1P58294 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PROK1P58294 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PROK1P58294 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PROK1P58294 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PROK1P58294 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PROK1P58294 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PROK1P58294 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms