Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT3AP56704 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WNT3AP56704 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms